Para conocer la historia de la alternancia en Misiones, hacemos hincapié en la publicación de UNEFAM denominada "Historia del Movimiento de las EFAs en Misiones". La historia de las EFAs de Misiones tiene dos caminos, ambos totalmente válidos se entrelazan y complementan mutuamente. Por una parte la provincia de Misiones tiene antecedentes de interés en la creación de EFAs desde el año 1.975, pero hay otros indicios que nos remontan a los años ‘73 y ‘74. Sucede que los Movimientos Rurales de Misiones y Santa Fé tenían fuertes contactos y es así que por ese entonces un grupo de chicas de esta provincia (de la zona ubicada hacia Pastoreo, Domingo Sabio) viajan a Santa Fé a realizar un curso de formación de Monitores en el antiguo ICAM (Instituto de Capacitación de Monitores), justamente por el interés de este movimiento de traer la idea de la EFA a nuestra provincia.

Es importante señalar que el Señor Humberto Suligoy visitó esta región e hizo un diagnóstico a tal fin, de lo cual quedan antecedentes.

Por otra parte quizá el mojón de toda esta historia está en los aborígenes ya que el Padre José Marx de la SVD trabajaba este aspeto entre otros, y por este motivo tenia contactos con la sede de INCUPO en Reconquista -Santa Fé- por cursos, venta de artesanías, etc.

El conocimiento y trabajo con INCUPO se da en tiempos en que Silvia de Pereda era Directora de esta Institución, y es a través de ella que el Padre José conoce a su esposo Jorge Pereda, quién por ese tiempo era Presidente de APEFA, circunstancia que le posibilitó conocer el sistema, interiorizarse, tener acceso y contactos con esta Asociación; y a través de ella con la experiencia. Allí conoce las EFAs, y se inician una serie de diálogos para convencer a Jorge Pereda para que apoyase la apertura de escuelas EFAs en Misiones. Entonces aquí comienza una larga historia de pedidos y gestiones sin éxito. Es que durante ese período del gobierno de facto no fue posible abrir nuevas escuelas, porque las autoridades nacionales de la SNEP (Superintendencia Nacional de Enseñanza Privada), no las autorizaban. Por el contrario, APEFA tuvo que cerrar varias escuelas como Colonia Elsa de Entre Ríos, Coronel Dugraty en el Chaco entre otras, como nos contara el mismo Jorge. Cuando el Gobierno Nacional aprobó el plan que permitiera la apertura de otras escuelas en el país, entonces recién APEFA dio el visto bueno y el Padre José invitó a que vengan a trabajar a Misiones, se destaca las visitas que hiciera a esta provincia el Sr. Jorge Pereda, como Vicepresidente de APEFA, y luego en 1986, nuevamente como presidente, y al trabajo del Área de Promoción el Sr. Alcides Petean y otras personas del Consejo de Administración de ese entonces, quiénes viajaron a nuestra provincia y al llegar se dirigieron a San Ignacio y tomaron contacto con el Padre José Marx e hicieron una semana de visitas por San Ignacio, Capiovisiño, Campo Viera y Campo Grande. La preocupación de APEFA, fue en todo momento que la decisión de abrir una escuela se viera respaldada por un grupo de padres de futuros alumnos, y la constitución de la Asociación EFA. con padres y dirigentes de cada comunidad, para asegurar su funcionamiento e inserción en el medio local, y no fuera la iniciativa de una sola persona o de la Iglesia. Basándose en la filosofía de APEFA y de su metodología de trabajo, ligada a los tres pilares de la escuela: la responsabilidad de las familias (plenamente ejercida en la gestión de la escuela a través de las asociaciones); la alternancia (reconocido en el plan de estudio); y el compromiso en el desarrollo local (a través de la asociación). Para la apertura de las escuelas se pensó trabajar con la provincia para lograr su reconocimiento, por lo cual se mantuvieron contactos con el Gobernador y las autoridades del área, quienes en principio se mostraron interesados y motivados por la apertura de tres de estas escuelas, pero con la intención de que sean estatales: una en Alberdi, otra en San Ignacio y la última en Capiovisiño. Pero por razones de presupuesto, se habilita solamente una, en la localidad de Alberdi, dependiendo ésta directamente del Consejo General de Educación de la Provincia de Misiones, por lo que se decide iniciar los trámites de apertura de las demás escuelas con la Nación a través de la Superintendencia Nacional de Enseñanza Privada, presentándose los tres primeros expedientes en Buenos Aires en 1.985: San Ignacio, Capiovisiño y Campo Viera. Resultado de estas visitas y tramitaciones surge en 1.986 la primera EFA. de la Provincia de Misiones: San Ignacio. Es importante rescatar que el Señor Alberto Roth formó parte de la primera Comisión Directiva de la EFA de San Ignacio como Socio Honorario y participó en la Asamblea de Conformación. Luego el mismo Don Alberto Roth escribió una carta a APEFA comentando que, conociendo Misiones, él veía que ésta es una provincia para abrir unas 50 EFAs El Padre José nos comenta que entre las razones por las cuales se inspira para traer el sistema de Alternancia a Misiones, tiene que ver con sus primeras experiencias, destacando la gran cantidad de colonias con nutridos grupos de jóvenes imposibilitados de acceder al saber, y resalta que en cada capilla de la primer Parroquia que le tocó atender cuando llegó en el año 5, tenía un grupo juvenil, y se apreciaba la necesidad de formación de los jóvenes; jóvenes inteligentes, sanos, buenos, pero carentes de formación adecuada y necesaria para mejorar sus tareas en el campo. Había que darles un mejor porvenir a estos jóvenes que apenas terminaban la escuela primaria y no podían llegar a recibir la formación de una escuela secundaria. Aparte y para los que salían de sus chacras con destino a ciudades, sin preparación, al azar, que no vayan a buscar trabajo sin una sólida preparación, sino que tengan una base. En un primer momento se pensó en cursos para ellos; luego vino el tema de las Cooperativas, pero estas dos alternativas fueron superadas cuando se conoció APEFA y el sistema de las Escuelas de la Familia Agrícola. Los primeros pasos fueron amplios, espaciados y compartidos: el interés del Movimiento Rural, la inquietud y la asistencia económica y apoyo del Padre José Marx, el asesoramiento Pedagógico-Político y administrativo de APEFA, y la fundamental ayuda de una o más personas representativas del lugar que reúna en torno de la idea a los agricultores y los mismos padres agricultores o no, que conformaron las primeras Comisiones o Consejos de Administración encargados de la difícil tarea material de las escuelas en una primera instancia y civil en una segunda". Esta es la secuencia de apertura de las EFAs en Misiones: